通过Windows操作系统，贝加莱还为PC、控制器和HMI应用程序提供了标准的操作系统。可以选择Windows 10 IoT Enterprise、Windows Embedded 8.1 Industry Pro和Windows 7以及模块化的嵌入式应用。
Linux或GNU/Linux系统是一个开放的基于Linux内核和GNU软件的类似Unix的多用户操作系统。GPL授权下Linux内核的广泛使用和商业应用可能起始于1992年。
Windows 10 IoT Enterprise 2021 LTSC
Windows 10 IoT Enterprise 2019 LTSC
Windows 10 IoT Enterprise
Linux for B&R 12
Linux for B&R 10
Terminal OS
Windows 10 IoT Enterprise
Windows 10 IoT Enterprise为工业应用提供了理想基础。IoT代表物联网，表示致力于所有设备的通用互联。Windows 10 IoT Enterprise与完整版本的Windows 10相一致，再加上先进的安全和锁定机制。作为带触摸屏功能HMI应用的完美基础，它还为提高系统安全性提供了更多可能。
贝加莱支持适用于64位系统的Windows 10 IoT Enterprise。该系统专为工业应用而设计，它将嵌入式系统特性与其它锁定功能相结合，使工业PC变得更安全。该系统基于完整版Windows 10，这确保了所有应用程序和驱动程序都是兼容的。它提供最佳触摸屏支持，以此作为直观的用户界面的基础。
单独配置设备
Windows Embedded 10 IoT Enterprise中的锁定功能可以单独进行配置，同时使系统更安全。除了锁定操作系统中的某些功能之外，微软还在Windows Embedded Standard 7和Windows 8中加入了统一写入过滤器功能。
这些功能包括“写入过滤器”、“基于文件的写入过滤器”和“注册表过滤器”。例如，它们可以被用于配置针对只读访问的闪存，或者仅允许访问某些注册表项。因此，注册表中的任何更改都将被重新传入RAM。其结果是，重新启动后的系统始终以相同配置启动。现有的数据存储介质如SSD或CFast可以被写保护。
Windows 10中支持的语言
和此前的Windows 7 Ultimate和Windows 8.1 Industry一样 – Windows 10 IoT Enterprise支持多种语言，涵盖所有主要语言，包括阿拉伯语和中文字符集。
阿拉伯语 | 荷兰语 | 俄语 |
保加利亚语 | 意大利语 | 瑞典语 |
中文 | 日语 | 塞尔维亚语 |
丹麦语 | 韩语 | 斯洛伐克语 |
德语 | 克罗地亚语 | 斯洛文尼亚语 |
英语 | 拉脱维亚语 | 西班牙语 |
爱沙尼亚语 | 立陶宛语 | 捷克语 |
芬兰语 | 挪威语 | 泰语 |
法语 | 波兰语 | 土耳其语 |
希腊语 | 葡萄牙语 | 乌克兰语 |
希伯来语 | 罗马尼亚语 | 匈牙利语 |
Windows Embedded 8.1 Industry Pro
凭借Windows Embedded 8.1 Industry Pro，微软的最新操作系统现在也可以用于工业领域。作为带触摸屏功能HMI应用的完美基础，它还为提高系统安全性提供了更多可能。
贝加莱支持Windows Embedded 8.1 Industry Pro形式的Windows 8，这一系统专门针对工业应用。Windows 8.1 Professional完整版可以确保所有应用程序和驱动程序是兼容的，基于此，这一新的Windows技术能够结合嵌入式系统特性，诸如额外的锁定功能使工业PC更安全。和Windows 8.1一样，Windows Embedded 8.1 Industry Pro改善了触摸屏效果，支持直观的用户界面。
Windows Embedded 8.1 Industry Pro支持以下语言：
阿拉伯语 | 希伯来语 | 罗马尼亚语 |
保加利亚语 | 荷兰语 | 俄语 |
中文（简体） | 意大利语 | 瑞典语 |
中文（台湾） | 日语 | 塞尔维亚语 |
中文（繁体） | 韩语 | 斯洛伐克语 |
丹麦语 | 克罗地亚语 | 斯洛文尼亚语 |
德语 | 拉脱维亚语 | 西班牙语 |
英语 | 立陶宛语 | 捷克语 |
爱沙尼亚语 | 挪威语 | 泰语 |
芬兰语 | 波兰语 | 土耳其语 |
法语 | 葡萄牙语（巴西） | 乌克兰语 |
希腊语 | 葡萄牙语（葡萄牙） | 匈牙利语 |
Windows 7
Windows 7提供了丰富的创新功能和性能改进。快速切换至省电模式、快速还原、低内存占用和高速检测USB设备仅仅是Windows 7提供的一小部分优势。在Windows 7 Professional中可以使用英语和德语，而Windows 7 Ultimate则支持多达35种不同的语言。贝加莱PC不需要进行产品激活，这对简化与机器自动化相关的后勤程序而言是一个巨大的优势。
Windows 7 Ultimate支持以下语言：
阿拉伯语 | 希伯来语 | 罗马尼亚语 |
保加利亚语 | 荷兰语 | 俄语 |
中文（简体） | 意大利语 | 瑞典语 |
中文（台湾） | 日语 | 塞尔维亚语 |
中文（繁体） | 韩语 | 斯洛伐克语 |
丹麦语 | 克罗地亚语 | 斯洛文尼亚语 |
德语 | 拉脱维亚语 | 西班牙语 |
英语 | 立陶宛语 | 捷克语 |
爱沙尼亚语 | 挪威语 | 泰语 |
芬兰语 | 波兰语 | 土耳其语 |
法语 | 葡萄牙语（巴西） | 乌克兰语 |
希腊语 | 葡萄牙语（葡萄牙） | 匈牙利语 |
Windows Embedded Standard 7
Windows Embedded Standard 7是Windows Embedded Standard 2009的后继产品。与以前的版本一样，这款嵌入式操作系统完全支持Automation PC 810，Panel PC 800和Power Panel 500设备。除了拥有Windows 7 Professional的功能之外，Windows Embedded Standard 7还包括嵌入式组件如增强型写入过滤器，基于文件的写入过滤器，注册表过滤器和USB启动。
Windows Embedded Standard 7可选两种不同的版本。它们之间的主要区别在于多语言支持方面。Windows Embedded Standard 7仅能使用单一语言，而Windows Embedded Standard 7 Premium支持同时安装多种语言。凭借Windows Embedded Standard 7，微软也已在安全领域内取得了实质性的改善。在高级版本中使用的AppLocker程序能够防止执行未知或潜在有害的应用程序，例如应通过网络或从直接连接的驱动器上安装的应用程序。分层的方法允许区分脚本（.ps1，.bat，.cmd，.vbs和.js），安装程序文件（.msi，.msp）以及库（.dll，.ocx）。也可以配置AppLocker以记录不想要的活动并将其显示在事件查看器中。Windows Embedded Standard 7可选32位和64位版本。还支持具有挑战性的64位应用。
贝加莱 Linux
由贝加莱开发的的 Linux 版本基于相应的 Debian 版本，它已经包含了设备必需的驱动程序，可以在不增加额外工作的情况下立即使用。